刑事诉讼中的专门机关是指依照法定职权进行事诉讼活动的国家执法机关。刑事诉讼中的专门机关有权依法采取诉讼中的强制措施和其他强制措施性的措施；有权依法收集调取证据，查明案件事实；有权依其职责适用法律作出具有国家强制力不从心诉讼决定。其中包括：

    １、公安机关 公安机关是国家行政机关，是各级人民政府的组成部分专门负责治安保卫工作

    。在刑事诉讼中，侦查、拘留、执行逮捕、预审由公安机关负责，实质上在执行着控诉职能。

    ２、检察机关 人民检察院是我国的法律监督机关，由最高人民检察院、地方各级人民检察院和专门人民检察院组成。上下级人民检察院之间是领导被领导的关系。检察、批准逮捕、检察机关直接受理的案件的侦查，由人民检察院负责。

    ３、审判机关 人民法院是代表国家行使审判权的司法机关。在审判阶段，人民法院始终处于主导地位，负责主持和指挥全部诉讼活动并对案件作出裁决。人民法院由最高人民法院、地方各级人民法院和专门人民法院组成。上下级人民法院之间是监督被监督的关系。

    ４、国家安全机关 国家安全机关是国家的安全保卫机关，是各级人民政府的组成部分。根据《关于国家安全机关行使公安机关的侦查、拘留、预审和执行逮捕的职权的决定》，国家安全机关承担原由公安机关主管间谍、特务案件的侦查工作。１９９６年修正的刑事诉讼法第４条规定：国家安全机关依照法律规定，办理危害国家安全的刑事安件，行使与公安机关相同的职权。由此进一步明确了国家安全机关在刑事诉讼中的地位和职权。